利用PCR產(chǎn)物混池重測(cè)序檢測(cè)梨褐皮關(guān)聯(lián)SLAF標(biāo)簽多態(tài)性
園藝學(xué)報(bào)
頁(yè)數(shù): 8 2024-03-07
摘要: 在已知梨褐皮關(guān)聯(lián)的SLAF標(biāo)簽(Marker286117)序列上存在4個(gè)SNP位點(diǎn),共有4個(gè)基因型(a~d)的基礎(chǔ)上,使用PCR加混池重測(cè)序技術(shù)鑒定該SLAF標(biāo)簽在64個(gè)梨品種中的多態(tài)性。共獲得7.1 Gb原始數(shù)據(jù),通過編譯的SNP-rseq和Calculate程序?qū)?shù)據(jù)進(jìn)行處理,64個(gè)梨樣品獲得的平均read數(shù)量為117 642條,滿足分析需求。在該SLAF標(biāo)簽上新發(fā)現(xiàn)2個(gè)基...