三色堇4,5-多巴雌二醇雙加氧酶基因的克隆及生物信息學(xué)分析

摘要： 本實驗以三色堇(Viola wittrockiana)的花瓣為研究材料,提取其總RNA,通過RACE(rapid-amplification of cDNA ends)技術(shù)擴(kuò)增4,5-多巴雌二醇雙加氧酶(4,5-DOPA dioxygenase extradiol)基因的cDNA全長,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。本實驗成功克隆VwDODA的cDNA全長1 055 bp,其中3'端非編碼區(qū)157 bp,包含29 bp Poly(A),5'端非編碼區(qū)103 bp,其開放閱讀框為795 bp,編碼263個氨基酸。通過NCBI的BLAST比對表明VwDODA編碼的氨基酸序列與其他植物相關(guān)基因的相似性達(dá)到80.29%,與大豆(Glycine max)親緣關(guān)系最近。通過生物信息學(xué)分析軟件對VwDODA的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果表明Vw D-%ODA是一種親水穩(wěn)定蛋白,不存在跨膜區(qū)域和信號肽,分子式為C1337H2026N356O384S7,等電點為6.70,分子量為29 455.37。本研究為將來三色堇中甜菜色素與花色素的互斥現(xiàn)象研究打下了基礎(chǔ)。 （共8頁）