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基于單細胞測序數(shù)據(jù)的拉克羅斯病毒感染神經(jīng)系統(tǒng)細胞基因表達差異分析

醫(yī)學信息 頁數(shù): 6 2024-09-01
摘要: 目的 分析受拉克羅斯病毒(LACV)感染的人腦類器官細胞不同亞群相關(guān)基因表達差異,揭示不同亞群之間的轉(zhuǎn)錄組特性。方法 選擇GEO數(shù)據(jù)庫中編號為GSE131434的單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),包含2個樣本,1個為模擬感染COs的作為陰性對照組,1個為受LACV感染的COs。采用R語言“seurat”包對數(shù)據(jù)進行過濾、歸一化、主成分分析、UMAP聚類分析,尋找COs亞群。通過“SingleR... (共6頁)

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