基于轉(zhuǎn)錄組與代謝組聯(lián)合分析馬爾尼菲籃狀菌毒力蛋白Mp1p對巨噬細(xì)胞的影響
中國熱帶醫(yī)學(xué)
頁數(shù): 6 2024-03-09
摘要: 目的 通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合代謝組學(xué)探索Mp1p對宿主巨噬細(xì)胞的影響。方法 使用慢病毒構(gòu)建穩(wěn)定表達(dá)Mp1p的THP-1巨噬細(xì)胞株(THP-1-Mp1p~+)。采用RNA高通量測序(RNA sequencing, RNA-Seq)技術(shù),在轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析中,檢測細(xì)胞內(nèi)mRNA的表達(dá)量,確定差異表達(dá)基因;在代謝組學(xué)分析中,通過數(shù)據(jù)庫比對進(jìn)行代謝物鑒定,對差異代謝物進(jìn)行通路分析,揭示潛在作用機... (共6頁)