藥用植物藤石松生藥和飲片中的微小RNA差異表達研究

摘要： 目的擬利用藤石松Lycopodiastrumcasuarinoides生藥與飲片中微小RNA(miRNA)表達譜,鑒定其中熱穩(wěn)定存在的miRNA,為今后藤石松miRNA生物藥效研究奠定基礎。方法選取藤石松的2種加工形態(tài)生藥與飲片全株樣品(包含莖、葉、分枝),采用IlluminaHiSeqTM2500高通量測序方法,根據(jù)miRNA家族在不同物種中的保守性,將miRBase數(shù)據(jù)庫中的已知植物miRNA與通過高通量測序獲得的藤石松miRNA序列進行比對,利用生物信息學方法,注釋藤石松中的所有miRNA序列,并鑒定生藥與飲片之間的差異表達miRNA分子,同時完成它們相應的人類靶基因預測,此外,對這些miRNA及靶基因進行GO和KEGG功能注釋分析。結果生藥組與飲片組分別獲得9898332、10099918條序列,其長度基本呈正態(tài)分布,而且均在21、24nt的位置上形成2個峰值。兩組顯著差異表達的miRNA共計25個,其中22個表達上調(diào),3個表達下調(diào)。GO分析結果表明miRNA靶基因涉及富集與結合、催化、分子轉(zhuǎn)導等分子功能以及細胞調(diào)控、代謝過程等生物過程。KEGG通路富集分析表明靶基因多集中于癌癥與免疫相關通路,如pathwaysincancer、proteoglycansincancer等信號通路。結論首次揭示了藤石松生藥與飲片的miRNA表達譜,存在潛在的可利用的植物來源的穩(wěn)定miRNA分子,為進一步研究藤石松中與癌癥或免疫相關的miRNAs分子藥理功能奠定基礎。 （共12頁）